1984年10月经林业部批准,南京林业大学成立了“南京林业大学林产工业设计所”。根据当时设计市场状况,设计重点主要是林产工业、制浆造纸专业。拥有的设计资质为农林行业(林产工业、营造林)乙级、林产化工(制浆造纸)乙级。
1992年经林业部批准,更名为“南京林业大学林产工业设计院”。
2004年市政公用(风景园林)设计资质升为甲级,2007年6月市政公用(风景园林)甲级资质获得转正。
2009年底,我院注册资本金增至300万元,2009年12月——2010年5月,经过江苏省住建厅、中华人民共和国住建部审批,我院完成资质换证工作,获得风景园林专项设计甲级资质、农林行业(林产工业工程、营造林工程、林产化学工程)专业设计乙级五年有效期证书。
2011年12月,我院完成了改制,成为南京林业大学资产经营公司的全资公司,名称变更为:南京林业大学工程规划设计院有限公司。
2015年5月,我院以上资质延续申请获得省住建厅、国家住建部批准。目前我院本部拥有专业技术人员60余人,其中国家一级注册建筑师1人、二级注册建筑师2人,国家一级注册结构师1人、二级注册结构师2人、国家注册咨询师2人,江苏省注册咨询专家6人、具有高级职称的设计人员20余人。